Трудовой договор и СЗ

Да, можете: статус самозанятой и работа по трудовому договору совмещаются свободно, закрывать самозанятость не нужно.

Налог на профессиональный доход платится только с доходов, полученных как самозанятой. Зарплата по трудовому договору облагается обычным НДФЛ, который удерживает работодатель, и в приложении «Мой налог» её отражать не нужно.

Единственное существенное ограничение: нельзя оказывать услуги как самозанятая своему текущему работодателю, а также бывшему, если с момента увольнения не прошло двух лет. Такой доход под льготную ставку не подпадает.

Если деятельность как самозанятой пока не ведётся — отчётность сдавать не нужно, обязательных взносов не возникает. Статус можно держать сколько угодно без движений по счёту.