Можно ли взыскать с самозанятого алименты на ребенка-инвалида в размере МРОТ?

Здравствуйте! Все зависит от того, для чего вам нужен учет доходов. Например, при оформлении пособия на ребенка от 3 до 7 лет пенсия ребенка учитывается, а вот выплаты по уходу за ним - нет. 

Что касается алиментов в твердой денежной сумме, то взыскать их с самозанятого можно, поскольку он имеет нерегулярный, меняющийся заработок (ст. 83 СК РФ):

1. При отсутствии соглашения родителей об уплате алиментов на несовершеннолетних детей и в случаях, если родитель, обязанный уплачивать алименты, имеет нерегулярный, меняющийся заработок и (или) иной доход, либо если этот родитель получает заработок и (или) иной доход полностью или частично в натуре или в иностранной валюте, либо если у него отсутствует заработок и (или) иной доход, а также в других случаях, если взыскание алиментов в долевом отношении к заработку и (или) иному доходу родителя невозможно, затруднительно или существенно нарушает интересы одной из сторон, суд вправе определить размер алиментов, взыскиваемых ежемесячно, в твердой денежной сумме или одновременно в долях (в соответствии со статьей 81 настоящего Кодекса) и в твердой денежной сумме.

Алименты в твердой денежной сумме определяются с учетом регионального прожиточного минимума на ребенка. Обычно истцы запрашивают 0.5-1 ПМ. 

Также вы можете взыскать дополнительные расходы на ребенка, если, например, ему требуется платный уход специалиста и есть подтверждающие документы из медорганизации (ст. 86 СК РФ):

1. При отсутствии соглашения и при наличии исключительных обстоятельств (тяжелая болезнь, увечье несовершеннолетних детей или нетрудоспособных совершеннолетних нуждающихся детей, необходимость оплаты постороннего ухода за ними, отсутствие пригодного для постоянного проживания жилого помещения и другие обстоятельства) каждый из родителей может быть привлечен судом к участию в несении дополнительных расходов, вызванных этими обстоятельствами.