Можно ли купить по жилищному сертификату квартиру меньшей площади?

Здравствуйте! Все зависит от условий программы, по которой вы получили этот сертификат. Они бывают как федеральными, так и региональными. Обычно сертификаты даются на определенную сумму, а не на конкретное количество квадратных метров. Соответственно, вы сможете его использовать на покупку любой недвижимости. 

Площадь жилья учитывается только в том случае, если, например, вашу квартиру на 42 кв.м. изымают, а взамен выдают сертификат. Тогда площадь имеет значение при расчете: количество квадратных метров умножается на среднюю стоимость 1 кв.м. в вашем регионе.